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三羧酸循环的过程与酶(一)

6月2日 醉殇别投稿
  三羧酸循环(TCAcycle)也叫柠檬酸循环或Krebs循环,一共8步。它是将乙酰辅酶A彻底氧化分解,生成二氧化碳的过程,属于分解代谢的第三阶段。
  三羧酸循环的第一步是辅酶A与草酰乙酸缩合,生成柠檬酸。由柠檬酸合酶(citrate(Si)synthase)催化,乙酰辅酶A的高能硫酯键水解推动反应进行。此酶是三羧酸循环的第一个关键酶,受ATP、NADH、琥珀酰辅酶A和长链脂肪酰辅酶A抑制。ATP可增加对乙酰辅酶A的Km。
  柠檬酸合酶催化的反应过程
  柠檬酸合酶以前的编号是EC4。1。3。7,但后来酶学委员会修改了分类规则,现在的编号是EC2。3。3。1,即看作乙酰基转移酶。氟乙酰辅酶A可形成氟柠檬酸,抑制下一步反应的酶,称为致死合成。氟乙酰胺、氟乙酸是其前体,以前曾用于杀虫剂和灭鼠药,但因流毒无穷,早已禁用。
  氟乙酸的致死合成
  氟乙酰胺剧毒,杀虫杀鼠固然立竿见影,但具有二次毒性,动物吃了死老鼠也会中毒,而且毒性可由污水传播,在植物体内滞留数月甚至数年(临床荟萃,2001)。这简直比欧阳锋的蛇毒还要可怕。
  氟乙酰胺导致二次中毒相关文献
  我国1982年禁止将氟乙酰胺用于灭鼠药,但在80年代末,含有氟乙酰胺的“邱氏鼠药”却红极一时。1992年,五位灭鼠专家揭露邱氏鼠药含有氟乙酰胺,却被生产者起诉侵犯名誉权。法院一审悍然判决原告胜诉,学界哗然,此即为90年代最为著名的科技官司,与有机锗案一起被戏称为“南猪北鼠”。
  三羧酸循环的第二步是柠檬酸转变为异柠檬酸。催化这个反应的顺乌头酸酶(aconitase)含有铁硫簇(4Fe4S),属于非铁卟啉铁蛋白。铁硫簇在催化过程中与底物结合,并参与催化过程。
  这一步看起来像是一个异构反应,但其实顺乌头酸的编号是EC4。2。1。3,属于裂合酶,正式名称是aconitatehydratase。这其实是两个连续的反应,先脱水,再加水,都由一个酶催化。其中间产物顺乌头酸可以稳定存在,也可以分离出来,所以不能看作异构反应的过渡态复合物。因为过渡态是不稳定的,寿命大约在皮秒级别,而且无法分离出来。
  前面提到,氟柠檬酸可以抑制这一步反应。其机制是氟柠檬酸被顺乌头酸酶催化,形成4羟基反乌头酸,然后与酶紧密结合。这种结合非常牢固,所以其毒性很强。但研究发现,这种结合并非不可逆的共价结合,加入百万倍的异柠檬酸可以使酶活性缓慢恢复(ProcNatlAcadSciUSA。1996)。所以这是一种竞争性抑制。
  顺乌头酸酶催化的反应及其活性中心
  三羧酸循环的第三步是异柠檬酸氧化脱羧,生成酮戊二酸(KG)。这是三羧酸循环中的第一次氧化,由异柠檬酸脱氢酶(Isocitratedehydrogenase,IDH)催化,生成NADH,中间物是草酰琥珀酸。这是第二个关键酶,能量高时被抑制。
  异柠檬酸脱氢酶催化的反应及其活性中心
  细胞质中有另一种异柠檬酸脱氢酶,需NADPH,称为NADPIDH。它位于胞质溶胶、线粒体和过氧化物酶体,在脂肪酸和胆固醇合成以及防止氧化损伤等过程中发挥重要作用。
  NADPIDH的突变与肿瘤有关。人体细胞质和线粒体中的NADPIDH分别称为IDH1和IDH2(线粒体中的NADIDH称IDH3)。IDH1和IDH2与肿瘤发生有关。目前已经在多种类型的肿瘤中鉴定出人IDH1和IDH2的突变,最常见的是神经胶质瘤,急性髓性白血病(AML),软骨肉瘤和肝内胆管癌。
  突变的IDH会失去正常功能,并产生新的功能,将KG转化为2羟基戊二酸(2HG)。2HG竞争性抑制KG依赖性酶,导致代谢改变和表观遗传失调。突变IDH的表达损害各种细胞谱系中的细胞分化,并与其他癌症基因一起促进肿瘤发展。现在第一代突变型IDH抑制剂已进入临床试验,并且已经在IDH2突变型AML患者中显示出令人鼓舞的结果(ClinCancerRes。2016)。
  IDH突变与肿瘤,引自ClinCancerRes。2016
  参考文献:
  王三德。急性氟乙酰胺中毒58例兼症分析。临床荟萃。2001(16)3:138139。
  H。Lauble,etal。Thereactionoffluorocitratewithaconitaseandthecrystalstructureoftheenzymeinhibitorcomplex。ProcNatlAcadSciUSA。1996Nov26;93(24):1369913703。
  OwenClark,etal。MolecularPathways:IsocitrateDehydrogenaseMutationsinCancer。ClinCancerRes。2016Apr15;22(8):183742。
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