手把手教你在NHANES库里下临床数据

　　美国国家健康与营养调查（NHANES，NationalHealthandNutritionExaminationSurvey）是一项旨在评估美国成人和儿童健康和营养状况的研究计划，该调查的独特之处在于它结合了访谈和体检。
　　NHANES是国家卫生统计中心（NCHS，NationalcenterforHealthStatistics）的主要计划，是国家营养监测的基石，为营养和健康政策的制定提供了大量数据。NHANES项目信息及调查数据会在网站上及时更新且向公众免费开放。本文通过介绍NHANES项目相关内容及数据提取方法，方便需要的研究者快速高效地获取自己需要地数据。
　　登陆网站
　　打开网站首页：https：www。cdc。govnchsnhanesindex。htm，该网站是属于CDC（CentersForDiseaseControlandPrevention），也就是美国疾病控制与预防中心
　　选择数据集
　　在左侧的导航栏中，选择我们感兴趣的Questionnaires，Datasets，andRelatedDocumentation，也就是调查问卷，数据集和相关文档一项。
　　选择数据年份
　　在这里我们看到虽然20172018年份已经存在，但在本文撰写时该数据还未整理完成，因此这里我们选择最近的日期，点击NHANES20152016。
　　选择需要的数据集
　　在Data，Documentation，Codebooks，SASCode一项中，有6项不同的数据，分别是DemographicsData（人口数据）、DietaryData（饮食数据）、ExaminationData（检查数据）、LaboratoryData（化验数据）、QuestionnaireData（问卷数据）、LimitedAccessData（限制访问数据）。这里我们以DemographicsData为例，明确如何应用。
　　2。5理解数据变量在上表中有几个重要内容，NHANES20152016DemographicsVariableList：人口数据的所有变量列表；DEMOIDoc：关于所有变量如何采集和数据类型的详细说明；DEMOIData〔XPT3。6MB〕：真实数据的下载链接。点击NHANES20152016DemographicsVariableList进入下一页，可以看到变量类型比如患者访谈时使用的语言，出生国家，是否为美国公民，学历，家庭人数等信息。
　　下载数据
　　返回上一页，点击DEMOIData〔XPT3。6MB〕，下载数据，该数据为XPT格式，也就是SAS软件的数据格式，可以使用SASUniversalViewer来查看，可以导入到R语言中，使用RStudio查看。
　　下载并安装R语言及RStudio
　　安装R语言RStudio必须在安装R语言的条件下才能使用，打开R语言网址，https：cran。rproject。org，选择适合自己电脑操作系统的版本安装。
　　安装RStudio进入RStudio网站，找到以下链接，点击进入：https：www。rstudio。comproductsrstudiodownloaddownload，选择适合的版本。这里我们选择最基本的免费版，选择适用自己电脑操作系统的版本，点击下载。下载完成后点击按照，此处无需特别设置。
　　启动RStudio安装完R语言之后启动，成功进入RStudio。
　　编写R语言脚本点击左上角的绿色，选择RScript，来创建一个新的R脚本。
　　编写代码导入数据输入以下代码来导入我们刚才下载的人口数据。
　　导入数据数据导入成功后，会以表格形式展示，可以看到，人口数据中总共有9971个样本，47个变量。SEQN是样本编号，以83736为例，可以看到RIDSTATR2，表示进行了面试和检查，RIAGENDER2，表示女性，RIDAGEYR42，表示42岁。
　　合并数据人口数据里面只有关于样本的特征信息，如我们需要研究特定人群的发病情况，需要合并多个表格数据进行分析。如我们想知道血压情况，同样的方法，先去下载到血压数据。
　　然后导入到RStudio，导入之后发现有9544个样本，21个变量，说明不是所有人都采集了血压信息。
　　将两个数据集合并成一个，取名为mergedata，下面是完整的加载两个数据集并合并的代码。
　　综合分析在合并后的数据中，我们可根据自己的研究领域进行查询，如在140190的人群分布。在合并后的数据中，点击Filter，在弹出的下拉菜单中可根据变量做各种条件过滤，比如选择BPXCHR中140190的人群，可看到共有166个样本符合该条件。
　　中心国家卫生统计中心连续开展的横断面调查收集了全国有关健康和营养状况的代表性数据，可以为流行病学家和营养学家提供全面的生物学、社会心理学、行为学及人口学等的信息。
　　与过去的健康调查一样，NHANES收集了有关人口中慢性病患病率的数据，通过调查，可估算出以前未确诊的情况，以及受访者已知和报告的情况。这些信息是NHANES计划的特殊优势。同时调查了风险因素，一个人的生活方式、体质、遗传或环境可能会增加患某种疾病或病症的机会。
　　研究吸烟、饮酒、性行为、吸毒、身体健康和活动、体重和饮食摄入量。还收集了关于生殖健康某些方面的数据，如使用口服避孕药和母乳喂养做法。
　　研究的疾病和健康指标包括：贫血、心血管疾病、糖尿病、环境暴露眼疾、听力损失、传染性疾病、肾脏疾病、营养、肥胖、口腔健康、骨质疏松、生育史和性行为、呼吸系统疾病（哮喘，慢性支气管炎，肺气肿）、性病、视力等，研究结果可用于确定慢性疾病的患病率和危险因素，便于研究者开展流行病学研究，并为政府公共卫生政策和卫生服务计划的制定提供依据。
　　参考来源：中国循证心血管医学杂志2019年6月第11卷第6期ChinJEvidBasedCardiovascMed，June，2019，Vol。11，No。6
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